法师护教之心并不仅仅局限于自己内心的笃信和潜修，而是每到一处，修建颓废殿宇整理经版文物。直1920年，祝兴寺兴建工程大体上竣工，法师应滇督唐继尧之请，移锡昆明的华亭寺，重兴古刹，改名云栖寺。虚云法师在此辛苦十载，百废俱兴。1934年，应广东诸护法及李汉魂将军之请，虚云法师又移锡曹溪，主持重兴六祖道场南华寺。1936年，林森、蒋介石、居正等在南华巡礼，他们都各自捐款修复殿堂。l943年，南华寺修建完毕，因知道粤北乳源县云门山大觉寺为禅宗五家云门宗之发源地，于是，法师又辞别曹溪，在云门开法。当此之时，云门残屋颓垣，只有祖殿尚存，却已岌岌可危，随时有倒塌的危险。法师决心重兴大觉禅寺，复振云门宗风。于是不分白天黑夜，亲自规划，事必躬亲，因高就远，牢地为基，大兴土木，广造梵宇。前后共历时九年，终于重建殿堂180余间，新塑圣像八十余尊，宝相庄严，梵刹清净。1953年正月，上海玉佛寺举办禅七法会两周，请虚云法师主法，期间编成《虚云老和尚禅七开启录》出版流通。后又应苏杭两地佛教界的邀请，到那里主法开示，并发起重建虎丘绍隆禅师塔。之后到北京出席中国佛教协会的成立会议。会议结束后，法师应山西大同云岗石窟，到武汉赴江西庐山养病，住在大林寺。当时云居山有几位禅人到大林寺参礼虚云法师，言谈中提到云居的情况，叹惜殿堂毁于日军侵略炮火，明代铜铸毗卢佛生于荒烟蔓草之中。法师得知这种情形后，恻然伤之，于是发愿重兴云居祖庭。在当地有关部门的帮助下，虚云法师率领向位弟子前往云居，结茅而居，以图复兴云居。各地僧人听说虚云法师到来，纷纷前来依止，不到一年，座下就集结了百余人。虚云法师一面组织僧众实行农禅生活，开荒种粮，植树造林；一面筹积资金，修复殿堂，以安僧众。到1954年夏天，新建法堂一座，楼上藏经，楼下安禅，新垦农田60亩，嘉禾满垅。衲僧满堂，耕田博饭，俨然一派百丈家风。1956年，法师继续督众兴工，建大雄宝殿、天王殿及钟鼓楼。云居的殿堂依地形的不同稍有变化，山中住人近200人，水田180亩，旱地70余亩，收稻谷4万多斤，杂粮2万多斤，粮食自给有余。至1959年，云居的修建工程基本上竣工。虚云法师把康熙时所编的《云居山志》寄到香港重印，并附录《重建云居山真如寺事略》于志末，记述中兴云居的因缘。

        虚云法师于国难当头之际，总是尽自己所能，助国家百姓。1936年，全国处于抗日救亡的紧急关头，当时法师正在曹溪主持南华寺，他提议全寺大众减省晚食、节积余粮，献给国家救助灾民。l940年，广州沦陷，1941年，曲江县严重缺粮，饥民甚多，虚老就将各方供养20多万元，全部交给广东省政府作为赈济灾民之用，1942年冬，国民政府主席林森派屈映光到广东，请虚云法师赴重庆主持“护国息灾法会”1943年1月26日 法会圆满，法会历时3个月，期间名公巨卿赠给虚云法师的名贵古玩及字画共5大箱，在归途中，他把这些东西全部分赠给各地寺庙，自己不留一物。侍者问及此事，虚老回答“徒费保存，徒乱人意”。

        虚云法师虽是禅宗大德，平生亦以振兴禅宗为己任，可他的思想并不偏狭，其特点是宗教并重，禅净并重，解、行并重，内外并重，他在谈到佛弟子如何适应时代的问题时认为，除戒定慧不能改动以外，佛弟子的日常生活，衣食住行都可以改变。既然中国佛教与印度相比，时间、地点、条件都变了，则佛教中的若干生活习惯，也应因时制宜。虚云法师的思想，以此可见一斑。

        法师一生经历也颇为坎坷，1958年春的“社会主义教育运动”和“反右派斗争”在全国佛教界展开，云居山亦不能免。 1959年10月13日 虚云法师自感老病交加，恐来日无多，对人讲话时，每每作嘱托语，这年的10月13日圆寂于云居茅蓬。法师圆寂的消息公布后，海内外佛教界同声震悼。台湾、香港、澳门，以及新加坡、美国、菲律宾、泰国、马来亚、越南等华人佛教界都举行法会，寄托哀思。虚云法师的一生，正如有篇纪念他的文章所说：“虚云和尚对传戒、讲经、做水陆、做法会样样都拿手，对于垦殖、建筑也样样在行。虚老修庙，从规划设计到具体施工，都是他亲自主持督导，从不烦劳他人。对于农事上开垦种植诸项，更是因地制宜，胸有成竹。法师一生弘扬佛法，利济群生，且悲深愿大，心坚行苦。虽出身富贵，至老不改其志，苦心修行，深受海内外佛教徒众信社会人士的尊仰与钦敬，是后辈人的楷模。”